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【资讯】我国领衔完成黄瓜全基因组变异图谱奇瓣马蓝

发布时间:2020-11-04 08:51:11 阅读: 来源:气瓶厂家

[导读]图为:黄瓜(配图) 日前,由中国农科院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队对115个黄瓜品系进行了深度重测序,并构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多… 图为:黄瓜(配图)

日前,由中国农科院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队对115个黄瓜品系进行了深度重测序,并构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础,这也是国际黄瓜基因组计划继2009年完成黄瓜全基因组序列图的绘制后的另一重大成果。相关研究已于10月20日在线发表在《自然·遗传学》杂志。

据国际黄瓜基因组计划的首席科学家、中国农科院蔬菜花卉研究所研究员黄三文介绍,科研团队在研究中对115个黄瓜品系进行了重测序,共发现330多万个单核苷酸多态性位点,33万多个小插入和删除和594个获得/缺失变异。基于这些所得数据,研究人员构建了一个单核苷酸分辨率的黄瓜遗传变异图谱。

研究中所挑选的115个黄瓜品系可分为印度类群、欧亚类群、东亚类群和西双版纳类群,其中印度类群主要来自于野生变种。通过比较分析发现,印度类群遗传多样性远远超过其他三个栽培变种。由此也证实了印度是黄瓜的发源地,也意味着野生资源中尚有很多待挖掘的基因资源。

野生黄瓜原本在印度被作为草药使用,果实小,口味苦,经过人类驯化,果实和叶片变大了,也没了苦味,变成了可口的蔬菜。本研究发现黄瓜基因组中有100多个区域受到了驯化选择,包含2000多个基因。其中7个区域包括了控制叶片和果实大小的基因,果实失去苦味的关键基因已经明确地定位在染色体5上一个包含67个基因的区域里,这为下一步克隆这一重要蔬菜驯化基因打下了基础。同时,研究还创造性地运用了群体分化这一新分析算法,发现了一个西双版纳黄瓜特有的突变,这一发现不仅为培育营养价值更高的黄瓜品种提供了分子育种工具,也为通过变异组快速挖掘重要性状基因提供了新思路。

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